Archives 2005 - 2019

Fel att analysera individuella gener i neandertalare

published Oct 19, 2007 11:27   by admin ( last modified Oct 19, 2007 11:27 )
Man har nu börjat titta på individuella gener i ben från neandertalare, och det är ingen smart idé. För för varje analys man gör så förstör man genetisk information om en massa gener man inte testar för. Det är bättre att vänta till vi har den teknik som krävs för att analysera ala generna. Som det är nu förstör man genetiskt material:

However, I question the value of probing for individual genetic variants in this way. Every probe takes a bit of sample, which might be more efficiently used in whole-genome sequencing. We have 25,000 genes, and every one is potentially interesting. Every small sample used to assay only one of those genes may destroy many sequences from the others. It would be one thing if samples were trivial and easily replaced, but they obviously aren't.


Läs mer: John Hawks Anthropology Weblog : 2007 10

Luftvärn betedde sig som galen Robocop, hade ihjäl 9, skadade 11

published Oct 19, 2007 06:49   by admin ( last modified Oct 19, 2007 06:49 )
En sydafrikansk datastyrd luftvärnskanon av märket Oerlikon fick fnatt och började svänga omkring och skjuta i alla möjliga riktningar. Tyvärr är den automatladdande och gick igenom alla 250 patroner innan den till slut tystnade. Nio personer dog och elva skadades.

Man måste ha känt sig väldigt maktlös i närheten av den, att ta skydd bakom en portfölj lär ju inte ge så mycket skydd, t ex.


But the brave, as yet unnamed officer was unable to stop the wildly swinging computerised Swiss/German Oerlikon 35mm MK5 anti-aircraft twin-barrelled gun. It sprayed hundreds of high-explosive 0,5kg 35mm cannon shells around the five-gun firing position. By the time the gun had emptied its twin 250-round auto-loader magazines, nine soldiers were dead and 11 injured.


Läs mer: IOL: 9 killed in army horror

Uppdatering:
Den sköt eventuellt bara åt ett håll, men det var där människorna befann sig.

Länk - Scrolla igenom alla svn -versioner av en fil med Googles SVN Time-Lapse

published Oct 19, 2007 06:41   by admin ( last modified Oct 19, 2007 06:41 )
SVN Time-Lapse View is a cross-platform viewer that downloads all revisions of a file and lets you scroll through them by dragging a slider. As you scroll, you are shown a visual diff of the current revision and the previous revision. Thus you can see how a file evolved, and you can easily find the revision at which lines appeared, disappeared, or changed.


Läs mer: svn-time-lapse-view - Google Code

Länk - Mjuk vävnad från T Rex hittad

published Oct 08, 2007 12:17   by admin ( last modified Oct 08, 2007 12:17 )
WASHINGTON - March 24, 2005 - For more than a century, the study of dinosaurs has been limited to fossilized bones. Now, researchers have recovered 70 million-year-old soft tissue, including what may be blood vessels and cells, from a Tyrannosaurus rex.


Läs mer: Scientists recover T. rex soft tissue - Science - MSNBC.com

Blindtarmen kan vara till för att nära goda bakterier vid kriser

published Oct 07, 2007 12:53   by admin ( last modified Oct 07, 2007 12:53 )
The abstract, for those who don't have access to the journal (article DOI doi:10.1016/j.jtbi.2007.08.032):


The human vermiform ("worm-like") appendix is a 5 to 10 cm long and 0.5 to 1
cm wide pouch that extends from the cecum of the large bowel. The architecture of the
human appendix is unique among mammals, and few mammals other than humans have
an appendix at all. The function of the human appendix has long been a matter of debate,
with the structure often considered to be a vestige of evolutionary development despite
evidence to the contrary based on comparative primate anatomy. The appendix is thought
to have some immune function based on its association with substantial lymphatic tissue,
although the specific nature of that putative function is unknown. Based (a) on a recently
acquired understanding of immune-mediated biofilm formation by commensal bacteria in
the mammalian gut, (b) on biofilm distribution in the large bowel, (c) the association of
lymphoid tissue with the appendix, (d) the potential for biofilms to protect and support
colonization by commensal bacteria, and (e) on the architecture of the human bowel, we
propose that the human appendix is well suited as a "safe house" for commensal bacteria,
providing support for bacterial growth and potentially facilitating re-inoculation of the
colon in the event that the contents of the intestinal tract are purged following exposure to a pathogen.


Läs mer: Purpose of Appendix Believed Found
Läs mer: Purpose of appendix believed found - CNN.com

Förbaskat snygg loggvisualisering i realtid

published Oct 07, 2007 07:38   by admin ( last modified Oct 07, 2007 07:38 )
# Multiple logfiles on multiple servers (via SSH & tail)
# Configurable layout
# Multiple logfile parsers (Apache Combined & Ruby on Rails included)
# Show only data you're interested in # Custom events
# Show rate, total or average # If you can 'tail' it, you can visualize it
# Written in Ruby using net-ssh & libopengl-ruby
# Free! (GPLv2)


Läs mer: glTail.rb - realtime logfile visualization

Länk - En man ville spränga sig inne på amerikanska ambassaden i Wien

published Oct 02, 2007 08:43   by admin ( last modified Oct 02, 2007 08:43 )
Three weeks after the arrest of suspected Jihadists in Austria, today the U.S. Embassy in Vienna foiled an apparent nail bomb attack by a 42 year old Bosnian man. The Bosnian man, who lives in Austria, was stopped with a backpack with hand grenades, nails, and Islamic literature as he tried to enter the U.S. Embassy in Vienna today. The Daily Telegraph reports that Doris Edelbacher, of Austria's counterterrorism office stated "There were a lot of nails in that bag. Had it exploded, it would have had an enormous shrapnel effect". The Bosnian man was detained after the metal detector stopped him and he attempted to flee, and the man is now being questioned.


Läs mer: Counterterrorism Blog: Austria: Attack on US Embassy in Vienna Foiled

Länk - Lista över de 50 bästa dystopi-filmerna

published Sep 30, 2007 10:51   by admin ( last modified Sep 30, 2007 10:51 )
We thought it would be interesting if we could coagulate the most commonly cited dystopian movies and rank them not to preference, but to an average score made up of both Rotten Tomatoes (RT) and IMDB ratings. As you all will probably know, the Internet Movie Database allows movie fans and registered users to rate each movie from 1 to 10 and the final score is said to reflect the general audience’s view of the movie. In contrast, Rotten Tomatoes rates their movies by collecting and tabulating the reviews given by professional film critics.


Läs mer: Top 50 Dystopian Movies of All Time

"Skor längtar ut", en miljö- och vetenskapsblogg

published Sep 30, 2007 02:08   by admin ( last modified Sep 30, 2007 02:08 )
Via Svd och Twingly hittade jag bloggen "Skor längtar ut". Den får bli ett bokmärke och hamna i nyhetsbevakaren. Exempel på artiklar:




dessutom: biolog, forskare, poet, filmare, filosof, fiskare, fotograf, fjällvandrare m.m. i varierande grad av aktivitet och professionalism.


Läs mer: Skor längtar ut

Kinas premiärminister vill ha demokrati i Burma(!)

published Sep 30, 2007 01:51   by admin ( last modified Sep 30, 2007 01:51 )
Via Aqurette såg jag att Kinas premiärminister Wen Jiabao utalat sig för demokrati i Burma:

Chinese Premier Wen Jiabao urged Burma to seek stability in a peaceful manner and work towards democracy and development, the government said. "China hopes that all parties concerned in Myanmar (Burma) show restraint, resume stability through peaceful means as soon as possible, promote domestic reconciliation and achieve democracy and development," Wen said.
Det är ju helt klart anmärkningsvärt. Är det ett uttalande bara för andra länder eller hur är det här tänkt att fungera? Hur kommer människor inne i Kina att tolka detta?

Läs mer: China urges restraint - World - smh.com.au

Länk - Trängselavgifter på banorna på flygplatser?

published Sep 29, 2007 12:12   by admin ( last modified Sep 29, 2007 12:12 )
The problem seems to be similar to that faced by urban transportation departments. Neither drivers nor air carriers are exposed to the full cost of congestion imposed on others by their use of an underpriced good--in one case roads, in the other runways, gate space, and the use of air-traffic controllers. Raising the price of those goods should reduce demand, alleviating congestion.


Läs mer: Runway gridlock | Free exchange | Economist.com

OS kunde inte kommit olämpligare för Kina

published Sep 29, 2007 02:07   by admin ( last modified Sep 29, 2007 02:07 )
Opinionen i väst och andra demokratiska länder hovrar nu omkring och funderar exakt vad man ska pressa kineserna på. Något blir det. Och vanliga människor har inte så mycket diplomatisk finess, så det kan nog slå gnistor.

Det innebär i klartext att OS är helt ur kontroll, ur Kinas synvinkel. Kina ska ju hålla OS 2008. Man som nation, centralt beslutat att göra en kraftansträngning att få detta att fungera bra. Det är nog lätt för den kinesiska regeringen att tro att andra, demokratiska, länder fungerar likadant. Det gör de inte.

OS är inget handelsavtal mellan anonyma multinationella bolag, ingen oljeleverans, det är ett evenemang som bygger på miljontals människors entusiastiska deltagande som utövare, funktionärer eller åskådare.

När bly upptäcktes i leksaker från Kina reagerade den kinesiska regeringen med beskyllningar, och den amerikanska leksaksföretaget Mattel bad Kina om ursäkt, vilket får räknas som en av de mer märkliga händelserna under året (även om skuldfrågan kan diskuteras vad gäller annat än blyinnehållet).

Det är svårt att tänka sig konsumenterna be Kina om ursäkt...

OS är verkligen i handen på människorna, individerna. Och då menar jag människorna i demokratiska länder. Mattel eller någon annan stor organisation, kan be om kinesiska regeringen om ursäkt, men folket i demokratiska länder har inga sådana hämningar.


Paradoxalt nog anser sig konsumenterna i demokratiska länder mindre känsliga för miljonförluster än politiker. Folket är tuffare än ledarna skulle man kunna säga.

Burma är just nu kandidat nummer ett för folkopinionen:



Enligt World Food Programme är så mycket som 60-70 procent av Burmas barn undernärda. Dessutom sprids HIV/AIDS mycket snabbt, och det föds många barn som bär på infektionen.


Läs mer: Matleveranser kommer inte fram

Länk - Bättre att ta DNA från hårstrån är från annan vävnad?

published Sep 28, 2007 11:42   by admin ( last modified Sep 28, 2007 11:42 )
Contamination from bacteria DNA generally make up 50 to more than 90 percent of the raw DNA extracted from the bone and muscles of ancient specimens, [University of Copenhagen reseracher Tom] Gilbert said. In contrast, more than 90 percent of the DNA extracted from hairs taken from woolly mammoth specimens in the new study belonged to the extinct mega-mammals themselves.


Läs mer: John Hawks Anthropology Weblog : 2007 09

Bilder burmademonstration Medborgarplatsen fredag 28/9

published Sep 28, 2007 06:18   by admin ( last modified Sep 28, 2007 06:18 )

burma4


En tio minuter innan utsatt tid såg det rätt glest ut:




burma1



Men när det väl började var där tusentals människor:


burma2




burma3



Utsnitt på munkarna som sjöng eller citerade ett kärleksbudskap enligt konferenciern:

burma5



Det var många talare. CUF-ordföranden Magnus Andersson gjorde ett kanontal, och analyserade situationen och Kinas roll, kritiserade FN och jämförde med Darfur vad gäller FN och Kina.



Tyvärr hade jag i överentusiasm klätt mig i mitt enda röda klädesplagg, en bomullströja, och jag frös som en hund. Därför gick jag efter en dryg halvtimme och hörde bara de första sju talarna eller så. Trots detta var det en mäktig upplevelse, speciellt när man tänker på att detta hände i många andra städer idag över hela världen.



Dagens Nyheter har nu en artikel om demonstartion, och så har Svenska Dagbladet.


CD-spelare kan konverteras till häftig labbscanner och processor

published Sep 27, 2007 10:39   by admin ( last modified Sep 27, 2007 10:39 )
Fixing two additional light sensors to a normal CD or DVD drive can transform it into a highly accurate scanner for chemical or medical tests, Spanish researchers have shown. The team has developed a modified CD drive that detected tiny quantities of pesticide in samples placed on top of an ordinary compact disk.


Läs mer: DIY lab scanner made from standard CD drive - tech - 25 September 2007 - New Scientist Tech

Och man kan använda centrifugalkrafterna till att flytta saker i steg över skivan:

This paper presents an integrated microfluidic device on a compact disk (CD) that performs an enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) for rat IgG from a hybridoma cell culture. Centrifugal and capillary forces were used to control the flow sequence of different solutions involved in the ELISA process. The microfluidic device was fabricated on a plastic CD. Each step of the ELISA process was carried out automatically by controlling the rotation speed of the CD.


Läs mer: Design of a Compact Disk-like Microfluidic Platform for Enzyme-Linked Immunosorbent Assay



Amöba i näsan - död inom 2 veckor (hu!)

published Sep 27, 2007 09:54   by admin ( last modified Sep 27, 2007 09:54 )
Tänk dej att du simmar och får upp vatten i näsan. Tänk dej att vattnet innehåller en viss amöba. Tänk dig att amöban får tag i luktnerven och börjar vandra upp längs den för att sedan käka upp hjärnan. Tänk... nä förresten, nu går det ju inte att  tänka längre.

Usch!

The amoeba destroys tissue as it makes its way up to the brain. People who are infected tend to complain of a stiff neck, headaches and fevers, Beach said. In the later stages, they'll show signs of brain damage such as hallucinations and behavioral changes. Once infected, most people have little chance of survival. Some drugs have been effective stopping the amoeba in lab experiments, but people who have been attacked rarely survive, Beach said.


Läs mer: Arizona Boy Dies Of Rare Infection - Local News Story - KPHO Phoenix

Burma - Demonstrationer i Stockholm imorgon fredag 14.00 (ny tid) & 17.00

published Sep 27, 2007 01:47   by admin ( last modified Sep 27, 2007 01:47 )

Har just fått info om att demonstrationen klockan 9 är flyttad till 14!


Det ska tydligen vara två demonstrationer i Stockholm imorgon fredag 28 september, en klockan 14 (obs ny tid)  utanför kinesiska ambassaden och en klockan fem på eftermiddagen på Medborgarplatsen:



Stötta burmeserna genom att demonstrera på fredag! Dagens första demonstration kommer att ta plats utanför kinesiska ambassaden i Stockholm klockan 9 på förmiddagen. Bland annat kommer svenska exilburmeser att medverka. Senare under dagen hålls en annan demionstration på medborgarplatsen, klockan 17.00.

Den burmesiska rörelsen har också under fredagen utlyst en sk. Red shirt campaign där de ber oss att bära röda tröjor under fredagen för att stödja burmeserna inne i landet.

Sprid gärna vidare, även om du själv inte kan komma!



(källa: Catharina Ullström)


Jag vet inte vilka huvudmännen är bakom dessa men det ser väl legit ut!



DN skriver om situationen i Burma just nu, nio döda i Rangoon enligt Svd.


Burma - Demonstrationer i Stockholm imorgon fredag 14.00 (ny tid) & 17.00

published Sep 27, 2007 01:47   by admin ( last modified Sep 27, 2007 01:47 )

Har just fått info om att demonstrationen klockan 9 är flyttad till 14!


Det ska tydligen vara två demonstrationer i Stockholm imorgon fredag 28 september, en klockan 14 (obs ny tid)  utanför kinesiska ambassaden och en klockan fem på eftermiddagen på Medborgarplatsen:



Stötta burmeserna genom att demonstrera på fredag! Dagens första demonstration kommer att ta plats utanför kinesiska ambassaden i Stockholm klockan 9 på förmiddagen. Bland annat kommer svenska exilburmeser att medverka. Senare under dagen hålls en annan demionstration på medborgarplatsen, klockan 17.00.

Den burmesiska rörelsen har också under fredagen utlyst en sk. Red shirt campaign där de ber oss att bära röda tröjor under fredagen för att stödja burmeserna inne i landet.

Sprid gärna vidare, även om du själv inte kan komma!



(källa: Catharina Ullström)


Jag vet inte vilka huvudmännen är bakom dessa men det ser väl legit ut!



DN skriver om situationen i Burma just nu, nio döda i Rangoon enligt Svd.


Dagens i-landsproblem: köer i närbutiker som går åt fel håll

published Sep 25, 2007 07:37   by admin ( last modified Sep 25, 2007 07:37 )

Många närbutiker är byggda som så att det är ingång på hörnet, med en disk innanför med samma form som hörnet, med en kassa på ena sidan, så här:



kassa1


Vad som ofta händer är att person nummer 2 ställer sig och anser att kön går till höger




kassa2

Nästa person, måste nu om hon vill stå i kön, blockera all trafik inne i närbutiken och ingången:




kassa3

Det hade varit mycket bättre om kön hade gått så här istället, alla nöjda:

kassa4

I ett försök att motverka att det blir en kö till höger kan man som tredje person försöka ställa sig i den rätta, imaginära, kön, men en liten bit bort för att markera att man inte tar köande nummer tvås plats:


kassa5

Köande nummer två brukar ha föga förståelse för detta:


kassa6



..och även om man formar en bra kö själv, kan man rälkna med att nån jävel vill starta en blockeringskö ändå:


kassa7


Man kan försöka vara så där osvensk extrovert och styra upp situationen med köförvirring:



kassa8



"Flertal"? Använd "flera"!

published Sep 24, 2007 05:12   by admin ( last modified Sep 24, 2007 05:12 )
Under senare år har det i svensk media smugit sig in en användning av ordet "flertal" som är olycklig. Ordet flertal kan enligt språkrådets databas Lexin betyda:


Svenskt uppslagsord
flertal [²fl'e:r_ta:l Uttal] flertalet subst.
majoritet; många, åtskilliga

Notera att man börjar med definitionen "majoritet". Och det är åtminstone så jag läser ordet "flertal". Vilket innebär att när DN skriver en artikel om tromber med denna ingress:



Flera tromber har orsakat kaos i England. Flertalet hus är förstörda och träd, grenar och delar av byggnader ligger nu på gatorna i flera städer. "Det lät som en bomb", säger en boende i staden Nuneaton till Sky News.
...så läser jag det som att England förötts och att majoriteten av hus på ön nu är raserade.

Det finns en enkel lösning: Använd ordet "flera" istället.

"flertal" ger ingen som helst uppfattning om hur många hus det rör sig om. Min gissning är sju stycken. Eller 22 miljoner, beroende på hur man tolkar ordet.

Läs mer: SvD: Tromber orsakade kaos i England